Do projektu zrekrutowani zostaną pacjenci ze zdiagnozowaną neutropenią wrodzoną wraz z członkami ich rodzin oraz pacjenci z neutropenią o podłożu immunologicznym. Pozwoli to na stworzenie rozbudowanej bazy danych, która wraz ze zgromadzonymi próbkami materiału (krew, szpik kostny, mocz) stanowić będzie swoiste repozytorium wiedzy mogące w przyszłości posłużyć do rozbudowywania projektu.
Zastosowane techniki sekwencjonowania nowej generacji oraz sekwencjonowania bezpośredniego umożliwią dokładne poznanie podłoża genetycznego neutropenii wrodzonej, jak również pozwolą na identyfikację zupełnie nowych genów mających związek z jej patogenezą i przebiegiem. Jednym z głównych założeń projektu jest wykorzystanie znakowanych sond peptydowych dedykowanych specyficznym proteazom neutrofilowym, które, w przypadku neutropenii uwarunkowanej genetycznie, charakteryzują się zmienną lokalizacją w neutrofilach. Pozwoli to na opracowanie szybkiego i niedrogiego testu diagnostycznego, umożliwiającego różnicowanie przyczyn neutropenii.
Wykorzystanie technologii CRISPR/Cas9 w korekcji hematopoetycznych komórek macierzystych CD34+ pochodzących od pacjentów, z następczym ich różnicowaniem w kierunku granulocytów obojętnochłonnych, umożliwi w przyszłości zastosowanie terapii komórkowej neutropenii wrodzonej oraz innych zaburzeń hematopoezy. Bezpieczeństwo i efektywność takiej terapii zostaną oszacowane na podstawie badań w modelach komórkowych ex vivo i modelach mysich in vivo. Wszystkie działania zastosowane w projekcie prowadzić będą do powstania nowego algorytmu diagnostycznego pacjentów z neutropenią oraz personalizacji ich leczenia.
| Autorzy publikacji | Tytuł publikacji | Czasopismo | Referencja | Data Publikacji |
| Poreba M*, Groborz K*, Rut W, Pore M, Snipas SJ, Vizovisek M, Turk B, Kuhn P, Drag M, Salvesen GS (*co-first authors) | Multiplexed probing of proteolytic enzymes using mass cytometry-compatible activity-based probes | The Journal of the American Chemical Society (JACS, IF – 14.6) | JACS, IF – 14.6 | 2020/09 |
| Joanna Madzio, Zuzanna Rydzyńska, Bartłomiej Pawlik, Damian Krzyzanowski1, Wojciech Mlynarski | Neutrophil elastase defects in congenital neutropenia | Frontiers in Immunology-Molecular Innate Immunity. | IF – 6.429 | 2021/04 |
| Paulina Kasperkiewicz | Peptidyl Activity-Based Probes for Imaging Serine Proteases | Frontiers in Chemistry | IF – 3.693 | 2021/04 |
| Damian Krzyzanowski, Aleksandra Oszer, Joanna Madzio, Maciej Zdunek, Julia Kolodrubiec, Bartosz Urbanski, Wojciech Mlynarski, Szymon Janczar | The paradox of autoimmunity and autoinflammation in inherited neutrophil disorders – in search of common patterns | Frontiers in Immunology | IF-7.3 | 2023/06 |
| Dobrewa W, Madzio J, Babol-Pokora K, Lopacz P, Gierszon A, Guz K, Orzinska A, Uhrynowska M, Jasinska A, Zdunek M, Mlynarski W, Janczar S. | A high prevalence of neutrophil-specific antibodies in ELANE-mutated severe congenital neutropenia. | Pediatric Blood & Cancer | IF-3.2 | 2023/02 |
| Stanisław Malicki, Mirosław Ksiązek , Alicja Sochaj Gregorczyk, Marta Kaminska , Anna Golda, Barbara Chruscicka, Danuta Mizgalska, Jan Potempa, Hans-Peter Marti, Joanna Kozieł, Maciej Wieczorek, Jerzy Pieczykolan, Piotr Mydeland Grzegorz Dubin |
Identification and characterization of aptameric inhibitors of human neutrophil elastase |
The Journal of Biological Chemistry | IF-5.48 | 2023/05 |
w budowie
w budowie
Wyprowadzenie hiPSc z modelu dostarczonego przez klienta
Modyfikacje genetyczne w komórkach eukariotycznych
Szkolenie z hodowli komórek iPS
Korzystanie z 4D-Nucleofector Core Unit + 4D-Nucleofector X Unit (Lonza)
Umowa o wspólne prowadzenie prac badawczych